異體骨髓移植前處置所用的高劑量化學藥物、放射治療以及移植後免疫抑制劑的使用，將病患之免疫系統造成相當大的影響，因此免疫力恢復之時間據以往之國外研究報告，體液性免疫球蛋白恢復必需花上一年的時間，而細胞性免疫球蛋白恢復的時間則需要2∼3年，但最近的報告說，這類病人的免疫力要完全恢復可能需要花上20年哪！

該項研究是由美國西雅圖Fred Hutchinson癌症研究中心的斯特雷克博士所主持，他將72名存活20∼30年以上之異體骨髓移植病患之免疫系統加以研究發現，單核細胞、B細胞、T細胞、自然殺手細胞以及具有殺菌能力之 IgG-2及IgG（免疫球蛋白）需20年才能恢復正常。

因此骨髓移植後還是比較容易發生感染，而感染率與年齡也有相關，例如小於18歲的病患，則平均每18年會發生一次嚴重感染，而成年病患則平均每11年會發生一次，常見的感染包括肺、副鼻竇、耳部、泌尿道、腎臟等，所以骨髓移植以後的病患，在衛生方面還是要多加注意。